天启的阴谋遭到正义的X战警们的顽强抵抗，X教授、魔形女、琴·格雷、镭射眼、夜行者、野兽、快银等变种人联起手来，与这个看似无法阻挡的敌人进行一场史诗对决。
最终天启被杀，世界被拯救。不过琴·格雷因为使用了凤凰之力，导致了黑凤凰的觉醒。
1995年美国的航天发射场，奋进号航天飞机刚刚升空，地面的控制人员在高空检测到一个类似太阳耀斑的巨大能量，随即飞船失联。
美国总统秘密给查尔斯教授打电话，要求出动X战警前去营救下落不明的宇航员。
查尔斯教授随即派魔形女担任队长，带着琴·格雷、镭射眼、蓝恶魔、风暴女、快银、野兽几人驾驶X战警的飞船飞入太空执行营救任务。
众人到了太空看到一大团暗红色的能量团在大肆涌动，而航天飞机就在能量团的边缘摇摇欲毁。
蓝恶魔带着快银传送到飞机，将座舱内的6名宇航员系悉数救出。但被救出的宇航员说还有一个机长没被救出。
当时航天飞机几乎已经被能量吞噬，魔形女因为觉得太过危险不想救剩下的那名机长。
但查尔斯教授坚持要将所有人救出。不得已，魔形女派琴·格雷与蓝恶魔再次飞入航天飞机搜救机长。
琴在飞机内用自己的意念力抵抗那股能量维持住飞机的形体，同时蓝恶魔去救人。但在蓝恶魔将人救出后，那股能量瞬间爆发直接冲向琴，琴瞬间化成一片火海。
为了不让扩散的爆炸能量伤到X战警的飞船，琴用仅存的意识将全部的能量导向了自己，瞬间发生了大爆炸。爆炸过后，蓝恶魔将琴的“尸体”带回了飞船。但琴不久后竟然自己苏醒了过来。众人虚惊一场。
回到地球，X战警因为营救了宇航员而受到英雄一般的礼遇。但魔形女与X教授爆发了激烈的冲突。X教授为了让人类接纳变种人，常常让X战警委曲求全，自己陷入危险境地。
而魔形女则认为X教授应该多考虑一下变种人自己的安危。野兽汉克对琴进行了体检，发现琴的能量大幅增加了，其能量高到现有的仪器根本测不出来。
晚上，在一个湖边，三个不明物体悄然降落。一群德巴力星人从中出现，它们杀害了附近一群正在聚餐的人们，并化装成他们的模样。
X战警的营地内，众人正在举行篝火派对庆祝任务胜利。琴发现自己的各种兴趣、冲动比以前强了不少。在喝下无数杯酒后，周围嘈杂的人声让琴再次失控，她释放出巨大的冲击波，将周围的树震断，将人击飞，而琴自己也失去意识昏倒在地。
正在受邀参加国宴的X教授通过心灵感应察觉到了琴的异样于是匆忙返回。
对着昏迷不醒的琴，X教授利用意识机器进入琴的思维。他发现琴的能量太过强大，以至于他在琴的脑中植入的一个“意识防火墙”濒临崩塌。